Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Siah1bQ06985 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Siah1bQ06985 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms