Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Caprin2Q05A80 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Caprin2Q05A80 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Caprin2Q05A80 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Caprin2Q05A80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Caprin2Q05A80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms