Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sox13Q04891 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox13Q04891 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms