Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox9Q04887 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms