Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col6a1Q04857 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms