Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nf1Q04690 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nf1Q04690 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms