Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RelaQ04207 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RelaQ04207 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RelaQ04207 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms