Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NfiaQ02780 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfiaQ02780 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms