Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms