Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Muc1Q02496 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Muc1Q02496 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms