Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctnnb1Q02248 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms