Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VcpQ01853 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VcpQ01853 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms