Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp1Q01514 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms