Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2bQ01097 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2bQ01097 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms