Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde1bQ01065 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms