Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PrcdQ00LT2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms