Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serpina1cQ00896 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serpina1cQ00896 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms