Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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