Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smyd1P97443 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms