Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nbr1P97432 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms