Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lig3P97386 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lig3P97386 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms