Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mesp1P97309 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms