Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms