Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arf1P84078 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Arf1P84078 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Arf1P84078 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms