Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcgP82348 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcgP82348 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgcgP82348 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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