Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irf3P70671 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms