Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf6P70279 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms