Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkn1P70268 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkn1P70268 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms