Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Traf5P70191 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms