Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SbdsP70122 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SbdsP70122 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms