Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcbP68404 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms