Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crnkl1P63154 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crnkl1P63154 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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