Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vsnl1P62761 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsnl1P62761 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms