Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PlnP61014 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PlnP61014 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PlnP61014 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PlnP61014 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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PlnP61014 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PlnP61014 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PlnP61014 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PlnP61014 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PlnP61014 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PlnP61014 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PlnP61014 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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PlnP61014 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms