Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ActbP60710 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ActbP60710 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ActbP60710 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ActbP60710 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms