Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3eP60229 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3eP60229 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms