Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubgcp3P58854 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubgcp3P58854 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms