Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Paxbp1P58501 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms