Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TdgP56581 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TdgP56581 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TdgP56581 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TdgP56581 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms