Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrp1P56183 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms