Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcanP55066 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcanP55066 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NcanP55066 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcanP55066 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms