Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pms2P54279 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pms2P54279 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pms2P54279 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms