Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cux1P53564 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms