Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map3k1P53349 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map3k1P53349 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms