Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox5P52651 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox5P52651 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms