Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr5P51682 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms