Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt6aP50446 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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