Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psen1P49769 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms