Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms