Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd1P48410 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms